重庆医科大学云校区位于重庆市大学城内，占地2116余亩，与渝中区老校区相距约35公里，西靠绵延的缙云山，东邻巍巍的歌乐山国家级森林公园，自然条件优越，环境优美，校区于2006年9月奠基、2007年9月正式启用。
历史沿革
为改善办学条件，确保教育教学质量，实现规模、结构、质量、效益的协调统一的目标，2005年学校在重庆大学城征地2116亩建设新校区。
2006年9月奠基，2007年9月落成，并入住首批师生。
新校区在巍巍的歌乐山和连绵的缙云山之间的大学城中路，距袁家岗校区34公里，坐落于缙云山脚，因此而得名缙云校区。
办学条件
院系概况
整体布局
缙云校区的建设采用一次规划，分期建设，预计总建筑面积93.9万平方米。现已竣工并投入使用的一期和二期工程，占地800余亩，拥有标准化田径场1个，教学、实验楼10幢、食堂1幢、风雨操场1幢及四个学生生活园区。还建有重庆市人类生命与健康博物馆。
目前行政中心、网络技术与信息中心、会议中心三大工程正在建设中。
入驻单位
缙云校区现入驻单位有：17个院、系、部等教学单位、1个实验教学管理中心，1个临床技能实验教学中心；12个管理部门。入驻教职工及有三个年级的本专科学生近15000人，其中来自15个国家留学生400余人。
校园环境
绿色校园生机盎然
以创建生态化、环保化、山水园林化的绿色校园为理念，在建设中以保留的泄洪冲沟、丘陵为基础，形成了适合野生动物生长的湿地、小溪和原生态小山丘。校园内植物繁多、四季鲜花盛开、满目葱茏，白鹭、天鹅、野鸭、鸸鹋、孔雀多姿多态，人与自然高度和谐。菁菁校园集校园、学园、乐园于一体，靓丽的景致和独特的人文景观每天都吸引着不少海内外宾朋。
数字化校园成现实
校区没有围墙，是一所开放式校园。良好的数字化远程视频监控、红外线报警探测、消防门禁远程控制及2110报警指挥系统等成就了校园开放的胸襟。在大学城学校中保持发案率最低。校园一卡通管理、全多媒体教室的使用、校区间视频会议系统的应用、校际间交流及重要讲座、培训的直播、录播等，使校内、校际资源得以共享，让数字化校园成为现实。
领导团队
缙云校区管委会是对缙云校区日常事务工作进行统筹管理与协调的综合行政管理机构，管委会设有4个直属部门：管委会办公室、教学与教学设施管理办公室、后勤办公室、保卫办公室。