藤本主税（1977年10月31日—），日本足球运动员，前日本国家男子足球队成员，曾效力于神户胜利船足球俱乐部，名古屋鲸八足球俱乐部，广岛三箭足球俱乐部，现效力于熊本罗亚素足球俱乐部。
2001年，藤本主税为日本国家足球队出场2次。
藤本主税的俱乐部履历丰富，他在不同的赛季和俱乐部中都有出场记录。他在大宫松鼠足球俱乐部的出场次数最多，从2005年至2011年，他在该俱乐部出场超过200次。