孙全谋，清朝武官官员，漳州市龙溪人。1788年（乾隆53年），孙全谋奉旨接替卓威光，在台湾地区担任台湾水师协副将，隶属台湾镇。在清朝台湾清治时期，孙全谋是全台湾海防军事层级最高武将，统帅三标水营，指挥数千名北洋水师兵勇。
孙全谋隶属台湾镇之下的此官职是台湾清治时期的这阶段，全台湾的海防军事层级最高武将，其统帅三标水营，数千名水师兵勇。
前任：
卓威光台湾水师协副将
1788年上任继任：
李芳园
李芳园台湾水师协副将
1791年上任继任：
陈光昭