化学分类学是一门综合性的学科，它以生物的化学成分及其合成途径的特征为基础，结合传统的分类学和其他相关学科的知识，旨在探究生物类群的特性、起源、亲缘关系及其系统发育规律。这一概念最早由荷兰生化学家R.海赫瑙尔在20世纪50年代末提出，并首先应用于植物，后来扩展至整个生物界。
学科历史
学科起源
化学分类学的历史可以追溯到人类早期对植物的利用。在中国，明代李时珍在其著作《本草纲目》中已经初步形成了将植物化学成分与植物系统位置相联系的概念。而在国外，S.阿博特等人也在19世纪提出了类似的观点，强调植物化学成分在揭示植物进化理论中的重要性。
学科发展
20世纪初期，随着科学技术的进步，特别是植物生化资料的积累和新技术的发展，如色谱分析和电泳技术，化学分类学开始成为一个快速发展的交叉学科。在动物领域，虽然研究起步相对较晚，但也取得了一些成果，如通过酶法和电泳法分析鸟类卵蛋白，确立了红鹳目等。
研究内容
化学分类学的研究内容主要包括两个方面：描述化学分类学和动态化学分类学。前者侧重于分离和研究植物成分的结构及其在植物界中的分布，而后者则关注生物合成途径的比较研究，以解决化学特征的平行性和多样性问题。此外，化学分类学还涉及了解生物体内化学成分的自我进化，以及根据化学成分及其合成途径，配合传统分类学及相关学科，研究生物类群的起源。
学科分类
植物化学分类学
植物化学分类学的应用化合物可分为初生代谢物、次生代谢物和带信息分子三大类。初生代谢物广泛分布在植物中，如乌头酸、柠檬酸等，而次生代谢物如生物碱、酚类等则是有价值的分类学资料。带信息分子如脱氧核糖核酸、核糖核酸、蛋白质等的研究虽尚未达到提供分类学准绳的水平，但其复杂度和分布范围对其分类学价值有着显著影响。
动物的化学分类学
动物的化学分类学研究历史相对较短，但仍有一些疑虑得到了澄清，部分系统得到了改善。例如，通过对鸟类卵蛋白的分析，确认了红鹳目作为独立的类群。然而，由于社会性昆虫类型的复杂性，以及其他因素的影响，相关的研究仍面临挑战。
参考资料
植物化学分类学(精).百度学术搜索.2024-11-04
药用植物化学分类学.百度学术搜索.2024-11-04
放线菌化学分类学的现状及发展趋势.百度学术搜索.2024-11-04