吴本杰，字芷献，为清朝官员，本籍福建省。于1886年（光绪12年）奉旨接替程起鹗，于台湾地区担任台湾府知府。
吴本杰字芷献，为中国清朝官员，本籍福建。吴本杰于1886年（光绪12年）奉旨接替程起鹗，于台湾地区担任台湾府知府。而此官职是台湾清治时期此期间，受台湾道制约的台湾地方父母官。（不含台北市）