美国能源部联合基因组研究所（DOE JGI）位于加州Walnut Creek，成立于1997年，以将能源部在LBNL、劳伦斯利弗莫尔国家实验室（LLNL）和洛斯阿拉莫斯国家实验室（LANL）基因组中心率先进行DNA测序、信息科学和技术发展中的专长和资源整合在一起。
本所简介
1999年，为加快完成能源部对人类基因组计划的承诺，负责管理DOE JGI的加利福尼亚大学，将在加州Walnut Creek轻工业园区实验室和办公室租赁出去，以巩固各项活动。这样做取得的重大规模经济使联合基因研究所成为第一个在自然杂志上发表的目标染色体5、16和19序列分析。继这一成就之后，DOE JGI通过测序20 多个微生物物种几种典型的生物体和将这一信息无偿地贡献给公共数据库继续推进基础科学。2004年，DOE JGI将自己确定为全国用户设施，而今天有超过2000名世界各地的用户。DOE JGI测序的绝大多数是在生物群落测序项目（CSP）赞助下进行的，测量生物圈以表征与能源部生物能源、全球碳循环和生物地球化学科学任务范围有关的生物体。DOE JGI的最大客户是美国能源部生物能源研究中心（BRCs），这些中心成立于2007年，旨在加速开发下一代纤维素生物燃料的基础研究。该研究所继续得到来自美国能源部科学局生物和环境研究处的大部分资金支持。
目前，DOE JGI已发展到占地八万平方英尺，聘请由国际公认的遗传学家、医学博士和哲学博士Eddy Rubin领导的250名员工。
本所伙伴
DOE JGI的伙伴实验室包括：LBNL、劳伦斯利弗莫尔国家实验室、洛斯阿拉莫斯国家实验室、橡树岭国家实验室和太平洋西北国家实验室（PNNL）以及哈森阿尔法生物技术研究院（以前与斯坦福人类基因组中心有关）。DOE JGI的劳动力大多从LBNL和劳伦斯利弗莫尔国家实验室抽调而来。