串珠藻科（学名：Batrachospermaceae）为红藻门的一个科。
藻体结构复杂，常为橄榄绿色或紫红色。藻体大型串珠状，具明显的中轴、节与节间，具胶质。卵式生殖，受精卵直接形成孢丝，无助细胞；果孢子萌发成与母体相同的配子体，无四分孢子体世代。
串珠藻科的藻类多数为淡水产，生活在湖泊、泉水或溪涧中。