小林三（1985年11月15日—），日本足球运动员，司职后卫，现效力于日本鸟栖砂岩足球俱乐部。
小林祐三的职业足球生涯开始于日本柏太阳神足球俱乐部。之后，他转会至横滨水手足球俱乐部，成为该队的主力球员，每年的出场次数都在30+，积累了丰富的比赛经验。在横滨水手效力期间，小林祐三被委任为队长。后来，他转会至鸟栖砂岩足球俱乐部，继续他的职业足球生涯。