方家沟遗址位于清水驿乡方家沟村东、西、南三面。属马家窑文化半山与马厂类型。
面积约3.2万平方米，文化层厚0.15--0.5米。采集有泥质红陶、夹砂红陶和软陶泥片和石斧。彩陶纹样属马家窑文化半山类型的有锯齿纹、宽带纹，器形有壶和罐；属马厂类型的有饰蛙纹的彩陶罐。遗址保存较好，对研究马家窑文化的内涵和兰州市地区古文化有重要价值。