新疆维吾尔自治区工商行政管理局曾是自治区人民政府主管市场监督管理和行政执法的综合部门。
2017年11月17日，获第五届全国文明单位称号。
获得荣誉
1979年自治区工商局重新组建以来，特别是自1996年以来，自治区工商局坚持以“弘扬时代精神，塑造工商形象，培养优良作风”为精神文明创建主题，以建设勤政，廉洁，高效，务实的一流文明机关为目标，结合行业特点和机关实际，紧紧围绕“工商形象建设年”和“公平交易执法年”活动，全面加强队伍建设，取得了丰硕的成果，被群众誉为维护经济次序的“卫士”。自治区工商局机关连续七年荣获自治区级文明单位称号，全区县以上工商局中，有60%获自治区级文明单位，30%获地区级文明单位，10%获县级文明单位，全系统实现了创建精神文明单位“满堂红”。在反腐纠风，普法教育，党的建设，依法治理等方面也取得了显著成效，先后受到国务院纠风办，国家工商局，自治区党委，政府的充分肯定和表彰。
内设机构
办公室
政治部
计划财务处
基建装备处
政策法规处
企业注册登记处
企业监督管理处
外资企业注册监督管理处
市场规范管理处
合同监督管理处
商标监督管理处
广告监督管理处
中华人民共和国消费者权益保护法处（12315投诉申诉举报指挥中心）
食品流通监督管理处
反垄断与反不正当竞争执法局
信息监督管理处
自治区工商局机关党委
离退休干部工作处