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反向重复序列

反向重复序列指两个序列相同的拷贝在脱氧核糖核酸链上呈反向排列,是DNA重复序列的一种类型。反向重复序列散布在整个基因组中,约占人类基因组中占5%,常见于基因的调控区,可能与基因的转录、复制有关。反向重复序列的一种形式是反向排列的两个拷贝间隔着一段序列,另一种形式是两个拷贝之间没有间隔序列,呈反向串联,这种结构又称回文式序列。起始序列和反向互补序列之间的核苷酸插入序列可以是任何长度,包括零。例如,5'---TTACGnnnnnnCGTAA---3' 是反向重复序列。而当插入序列长度为零时,该复合序列为回文序列。反向重复和定向重复序列均构成重复出现的核酸序列的类型。

术语简介

反向重复序列 (inverted repeat 序列):GTGCTAA和TTAGCAC构成反向重复序列。在双链脱氧核糖核酸中反向重复可能引起十字形结构的形成。上面的序列为反向重复序列,同时,注意到它两条链顺读是一样的,且中间没有间隔序列,因此它是回文序列。

回文结构(palindromic structure):在真核生物染色质DNA分子中,还存在大量特殊的序列,这种结构中脱氧核糖核苷酸的排列在DNA两条链中顺读与倒读其意义是一样的,脱氧核苷酸的排列对于一个假象的轴成180°旋转对称,这种结构称为回文结构。

几种重复序列辨析(非正式名词解释):

参考资料